বাংলাদেশ ধান গবেষণা ইনস্টিটিউটের উদ্ভিদ রোগতত্ত্ব বিভাগ ১লা অক্টোবর, ১৯৭০ সাল থেকে সীমিত জনবল নিয়ে ধানের রোগের উপর প্রাতিষ্ঠানিক ভাবে গবেষণা কার্যক্রম শুরু করে । সত্তর এর দশকে খাদ্যের তীব্র ঘাটতি থাকার কারণে একর প্রতি ফলন বৃদ্ধি করাই মূল লক্ষ্য ছিল। তবে যে সব কারনে ফলন হ্রাস পায় তার মধ্যে রোগবালাই এর আক্রমণ অন্যতম।

এখানে উল্লেখ্য যে ১৯৪৩ এর দুর্ভিক্ষের অন্যতম কারণ ছিল হেলমিনথোস্পোরিয়াম (বাদামী দাগ) রোগের আক্রমণের মাধ্যমে ধানের ব্যাপক ক্ষতি। সে দুর্ভিক্ষে এ দেশে লক্ষ লক্ষ মানুষের মৃত্যুতে এক হৃদয় বিদারক ইতিহাস রচিত হয়েছিল। উদ্ভিদ রোগতত্ত্ব বিভাগ ধানের রোগ নির্ণয় ও রোগ দমনের জন্য অত্র ইনস্টিটিউটের প্রতিষ্ঠালগ্ন থেকে অদ্যাবধি গবেষণার মাধ্যমে নতুন নতুন প্রযুক্তি উদ্ভাবন করে আসছে । এ পর্যন্ত বাংলাদেশে ধানের ৩২ টি রোগ সনাক্ত করা হয়েছে । এদের মধ্যে ২ টি ভাইরাস, ৩ টি ব্যাকটেরিয়া, ২২ টি ছত্রাক এবং ৫ টি কৃমি দ্বারা সংঘটিত হয়। এদের মধ্যে ১০ টি মূখ্য রোগ যা ধানের মারাত্নক ক্ষতি করে থাকে । বাকী ২২ টি রোগ দ্বারা ফসলের ক্ষতি কম হয় বলে এরা গৌণ রোগ হিসাবে পরিচিত । উদ্ভিদ রোগতত্ত্ব বিভাগে এ পর্যন্ত ত্রিশের উপরে ধানের রোগ দমনের কৌশল উদ্ভাবন করেছে যা মাঠ পর্যায়ে প্রয়োগ করা হচ্ছে । টেকসই রোগ ব্যবস্থাপণার জন্য ধানের ব্লাস্ট, ব্যাকটেরিয়া ও টুংরো রোগ প্রতিরোধী জাত উদ্ভাবনের কাজ এগিয়ে চলছে। নতুন নতুন প্রযুক্তি উদ্ভাবন করে বই, বুকলেট , লিফলেট ও ভিডিও ক্লিপ আকারে প্রকাশ করে কৃষক ও সম্প্রসারণ কর্মীদের মধ্যে বিতরণ করা হচ্ছে।

বর্তমানে উদ্ভিদ রোগতত্ত্ব বিভাগ বিভিন্ন প্রকণ্পের মাধ্যমে কার্যক্রম পরিচালনা করছে যেমন: 
১) ধানের রোগের উপর জরিপ এবং পর্যবেক্ষণ; 
২) প্রধান রোগজীবানুর পপুলেশন কাঠামো এবং জীববৈচিত্র অধ্যায়ন; 
৩) রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা এবং রোগজীবানুর মলিকুলার গবেষণা; 
৪) রোগের ইপিডেমিওলজি, ফলন ক্ষতি এবং শস্য মানের অধ্যায়ন; 
৫) ধানের রোগের ব্যবস্থাপনা; এবং 
৬) পেস্টিসাইডের মূল্যায়ন;
৭) প্রযুক্তি বিস্তার 
৮) ক্লিনিকাল সার্ভিসেস (ধানের রোগজীবানু সনাক্তকরণ ও ব্যাবস্থাপত্র প্রদান) যা বাংলাদেশের টেকসই উন্নয়ন লক্ষ্যমাত্রা (SDGs) অর্জনে অবদান রাখবে।